Protein–RNA interactions for Protein: O95931

CBX7, Chromobox protein homolog 7, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX7O95931 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX7O95931 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX7O95931 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX7O95931 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX7O95931 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX7O95931 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX7O95931 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX7O95931 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX7O95931 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX7O95931 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX7O95931 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX7O95931 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX7O95931 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX7O95931 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX7O95931 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX7O95931 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX7O95931 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX7O95931 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX7O95931 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX7O95931 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX7O95931 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX7O95931 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX7O95931 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX7O95931 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBX7O95931 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBX7O95931 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CBX7O95931 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBX7O95931 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBX7O95931 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBX7O95931 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBX7O95931 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBX7O95931 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBX7O95931 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBX7O95931 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBX7O95931 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBX7O95931 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBX7O95931 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBX7O95931 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CBX7O95931 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBX7O95931 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBX7O95931 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBX7O95931 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBX7O95931 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBX7O95931 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBX7O95931 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBX7O95931 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBX7O95931 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBX7O95931 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CBX7O95931 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBX7O95931 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBX7O95931 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CBX7O95931 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBX7O95931 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBX7O95931 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBX7O95931 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBX7O95931 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBX7O95931 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBX7O95931 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBX7O95931 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBX7O95931 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBX7O95931 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBX7O95931 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBX7O95931 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBX7O95931 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBX7O95931 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CBX7O95931 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBX7O95931 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBX7O95931 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBX7O95931 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBX7O95931 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX7O95931 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX7O95931 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX7O95931 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX7O95931 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX7O95931 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX7O95931 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX7O95931 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX7O95931 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX7O95931 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX7O95931 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX7O95931 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX7O95931 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX7O95931 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX7O95931 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX7O95931 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX7O95931 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX7O95931 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX7O95931 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX7O95931 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX7O95931 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX7O95931 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX7O95931 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX7O95931 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX7O95931 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX7O95931 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX7O95931 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX7O95931 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX7O95931 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX7O95931 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX7O95931 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms