Protein–RNA interactions for Protein: O60271

SPAG9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG9O60271 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPAG9O60271 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPAG9O60271 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SPAG9O60271 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPAG9O60271 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SPAG9O60271 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPAG9O60271 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPAG9O60271 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPAG9O60271 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPAG9O60271 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPAG9O60271 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPAG9O60271 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPAG9O60271 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPAG9O60271 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPAG9O60271 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPAG9O60271 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPAG9O60271 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPAG9O60271 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPAG9O60271 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPAG9O60271 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPAG9O60271 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPAG9O60271 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPAG9O60271 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPAG9O60271 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SPAG9O60271 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPAG9O60271 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPAG9O60271 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPAG9O60271 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPAG9O60271 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPAG9O60271 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPAG9O60271 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPAG9O60271 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPAG9O60271 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPAG9O60271 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SPAG9O60271 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPAG9O60271 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPAG9O60271 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPAG9O60271 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPAG9O60271 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SPAG9O60271 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPAG9O60271 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPAG9O60271 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPAG9O60271 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SPAG9O60271 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPAG9O60271 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPAG9O60271 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPAG9O60271 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPAG9O60271 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPAG9O60271 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPAG9O60271 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPAG9O60271 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SPAG9O60271 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPAG9O60271 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPAG9O60271 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPAG9O60271 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPAG9O60271 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SPAG9O60271 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPAG9O60271 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPAG9O60271 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPAG9O60271 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPAG9O60271 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPAG9O60271 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SPAG9O60271 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SPAG9O60271 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPAG9O60271 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPAG9O60271 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SPAG9O60271 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPAG9O60271 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPAG9O60271 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPAG9O60271 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPAG9O60271 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPAG9O60271 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPAG9O60271 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPAG9O60271 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPAG9O60271 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPAG9O60271 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPAG9O60271 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SPAG9O60271 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPAG9O60271 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPAG9O60271 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPAG9O60271 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPAG9O60271 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPAG9O60271 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPAG9O60271 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPAG9O60271 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPAG9O60271 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPAG9O60271 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPAG9O60271 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPAG9O60271 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPAG9O60271 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPAG9O60271 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPAG9O60271 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SPAG9O60271 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SPAG9O60271 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPAG9O60271 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPAG9O60271 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPAG9O60271 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPAG9O60271 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPAG9O60271 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPAG9O60271 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
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