Protein–RNA interactions for Protein: O15047

SETD1A, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1AO15047 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SETD1AO15047 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SETD1AO15047 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SETD1AO15047 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SETD1AO15047 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SETD1AO15047 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SETD1AO15047 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SETD1AO15047 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SETD1AO15047 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SETD1AO15047 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SETD1AO15047 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SETD1AO15047 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SETD1AO15047 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SETD1AO15047 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SETD1AO15047 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SETD1AO15047 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SETD1AO15047 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SETD1AO15047 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SETD1AO15047 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SETD1AO15047 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SETD1AO15047 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SETD1AO15047 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SETD1AO15047 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SETD1AO15047 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SETD1AO15047 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SETD1AO15047 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SETD1AO15047 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SETD1AO15047 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SETD1AO15047 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SETD1AO15047 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SETD1AO15047 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SETD1AO15047 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SETD1AO15047 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SETD1AO15047 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SETD1AO15047 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SETD1AO15047 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SETD1AO15047 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SETD1AO15047 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SETD1AO15047 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SETD1AO15047 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SETD1AO15047 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SETD1AO15047 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SETD1AO15047 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SETD1AO15047 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SETD1AO15047 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SETD1AO15047 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SETD1AO15047 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SETD1AO15047 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SETD1AO15047 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SETD1AO15047 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SETD1AO15047 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SETD1AO15047 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SETD1AO15047 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SETD1AO15047 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SETD1AO15047 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SETD1AO15047 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SETD1AO15047 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SETD1AO15047 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SETD1AO15047 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SETD1AO15047 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SETD1AO15047 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SETD1AO15047 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SETD1AO15047 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SETD1AO15047 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SETD1AO15047 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SETD1AO15047 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SETD1AO15047 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SETD1AO15047 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SETD1AO15047 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SETD1AO15047 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SETD1AO15047 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SETD1AO15047 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SETD1AO15047 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SETD1AO15047 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SETD1AO15047 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SETD1AO15047 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SETD1AO15047 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SETD1AO15047 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SETD1AO15047 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SETD1AO15047 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SETD1AO15047 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SETD1AO15047 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SETD1AO15047 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SETD1AO15047 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SETD1AO15047 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SETD1AO15047 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SETD1AO15047 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SETD1AO15047 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SETD1AO15047 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SETD1AO15047 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SETD1AO15047 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SETD1AO15047 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SETD1AO15047 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SETD1AO15047 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SETD1AO15047 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SETD1AO15047 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SETD1AO15047 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SETD1AO15047 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SETD1AO15047 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SETD1AO15047 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms