Protein–RNA interactions for Protein: K7ERE1

TMEM256-PLSCR3, TMEM256-PLSCR3 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 68 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
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TMEM256-PLSCR3K7ERE1 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
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