Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6X2

PIAS3, E3 SUMO-protein ligase PIAS3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIAS3Q9Y6X2 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PIAS3Q9Y6X2 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PIAS3Q9Y6X2 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PIAS3Q9Y6X2 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PIAS3Q9Y6X2 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PIAS3Q9Y6X2 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PIAS3Q9Y6X2 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PIAS3Q9Y6X2 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PIAS3Q9Y6X2 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PIAS3Q9Y6X2 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PIAS3Q9Y6X2 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PIAS3Q9Y6X2 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PIAS3Q9Y6X2 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PIAS3Q9Y6X2 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PIAS3Q9Y6X2 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PIAS3Q9Y6X2 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PIAS3Q9Y6X2 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PIAS3Q9Y6X2 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PIAS3Q9Y6X2 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PIAS3Q9Y6X2 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PIAS3Q9Y6X2 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PIAS3Q9Y6X2 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PIAS3Q9Y6X2 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PIAS3Q9Y6X2 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PIAS3Q9Y6X2 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PIAS3Q9Y6X2 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PIAS3Q9Y6X2 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PIAS3Q9Y6X2 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PIAS3Q9Y6X2 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PIAS3Q9Y6X2 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PIAS3Q9Y6X2 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PIAS3Q9Y6X2 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PIAS3Q9Y6X2 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PIAS3Q9Y6X2 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PIAS3Q9Y6X2 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PIAS3Q9Y6X2 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PIAS3Q9Y6X2 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PIAS3Q9Y6X2 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PIAS3Q9Y6X2 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PIAS3Q9Y6X2 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PIAS3Q9Y6X2 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PIAS3Q9Y6X2 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PIAS3Q9Y6X2 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PIAS3Q9Y6X2 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PIAS3Q9Y6X2 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PIAS3Q9Y6X2 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PIAS3Q9Y6X2 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PIAS3Q9Y6X2 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PIAS3Q9Y6X2 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PIAS3Q9Y6X2 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PIAS3Q9Y6X2 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PIAS3Q9Y6X2 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PIAS3Q9Y6X2 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PIAS3Q9Y6X2 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PIAS3Q9Y6X2 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PIAS3Q9Y6X2 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PIAS3Q9Y6X2 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PIAS3Q9Y6X2 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PIAS3Q9Y6X2 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PIAS3Q9Y6X2 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PIAS3Q9Y6X2 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PIAS3Q9Y6X2 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PIAS3Q9Y6X2 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PIAS3Q9Y6X2 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PIAS3Q9Y6X2 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PIAS3Q9Y6X2 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PIAS3Q9Y6X2 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PIAS3Q9Y6X2 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PIAS3Q9Y6X2 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PIAS3Q9Y6X2 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PIAS3Q9Y6X2 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PIAS3Q9Y6X2 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PIAS3Q9Y6X2 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PIAS3Q9Y6X2 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PIAS3Q9Y6X2 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PIAS3Q9Y6X2 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PIAS3Q9Y6X2 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PIAS3Q9Y6X2 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PIAS3Q9Y6X2 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PIAS3Q9Y6X2 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PIAS3Q9Y6X2 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PIAS3Q9Y6X2 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PIAS3Q9Y6X2 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PIAS3Q9Y6X2 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PIAS3Q9Y6X2 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PIAS3Q9Y6X2 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PIAS3Q9Y6X2 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PIAS3Q9Y6X2 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PIAS3Q9Y6X2 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PIAS3Q9Y6X2 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PIAS3Q9Y6X2 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PIAS3Q9Y6X2 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PIAS3Q9Y6X2 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PIAS3Q9Y6X2 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PIAS3Q9Y6X2 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PIAS3Q9Y6X2 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PIAS3Q9Y6X2 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PIAS3Q9Y6X2 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PIAS3Q9Y6X2 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PIAS3Q9Y6X2 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms