Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D8

HECTD4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HECTD4, humanhuman

Predictions only

Length 3,996 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4Q9Y4D8 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC10.69□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC10.69□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC10.68□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC10.68□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.68□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC10.68□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC10.68□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC10.68□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC10.68□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC10.68□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms