Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms