Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
USP18Q9UMW8 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
USP18Q9UMW8 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
USP18Q9UMW8 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
USP18Q9UMW8 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
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