Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms