Protein–RNA interactions for Protein: Q9P270

SLAIN2, SLAIN motif-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLAIN2Q9P270 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLAIN2Q9P270 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLAIN2Q9P270 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLAIN2Q9P270 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLAIN2Q9P270 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLAIN2Q9P270 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLAIN2Q9P270 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLAIN2Q9P270 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLAIN2Q9P270 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLAIN2Q9P270 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SLAIN2Q9P270 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLAIN2Q9P270 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLAIN2Q9P270 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SLAIN2Q9P270 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLAIN2Q9P270 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLAIN2Q9P270 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SLAIN2Q9P270 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLAIN2Q9P270 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLAIN2Q9P270 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLAIN2Q9P270 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLAIN2Q9P270 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLAIN2Q9P270 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLAIN2Q9P270 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLAIN2Q9P270 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLAIN2Q9P270 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLAIN2Q9P270 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLAIN2Q9P270 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLAIN2Q9P270 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLAIN2Q9P270 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLAIN2Q9P270 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLAIN2Q9P270 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLAIN2Q9P270 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLAIN2Q9P270 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SLAIN2Q9P270 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLAIN2Q9P270 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLAIN2Q9P270 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLAIN2Q9P270 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLAIN2Q9P270 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLAIN2Q9P270 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLAIN2Q9P270 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLAIN2Q9P270 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLAIN2Q9P270 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLAIN2Q9P270 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLAIN2Q9P270 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLAIN2Q9P270 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLAIN2Q9P270 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SLAIN2Q9P270 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SLAIN2Q9P270 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLAIN2Q9P270 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLAIN2Q9P270 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLAIN2Q9P270 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLAIN2Q9P270 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLAIN2Q9P270 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLAIN2Q9P270 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLAIN2Q9P270 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLAIN2Q9P270 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLAIN2Q9P270 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLAIN2Q9P270 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLAIN2Q9P270 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLAIN2Q9P270 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SLAIN2Q9P270 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLAIN2Q9P270 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLAIN2Q9P270 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLAIN2Q9P270 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLAIN2Q9P270 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLAIN2Q9P270 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SLAIN2Q9P270 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLAIN2Q9P270 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLAIN2Q9P270 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLAIN2Q9P270 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLAIN2Q9P270 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLAIN2Q9P270 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLAIN2Q9P270 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLAIN2Q9P270 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLAIN2Q9P270 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLAIN2Q9P270 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLAIN2Q9P270 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLAIN2Q9P270 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLAIN2Q9P270 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLAIN2Q9P270 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SLAIN2Q9P270 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLAIN2Q9P270 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLAIN2Q9P270 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SLAIN2Q9P270 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLAIN2Q9P270 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SLAIN2Q9P270 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLAIN2Q9P270 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLAIN2Q9P270 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLAIN2Q9P270 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLAIN2Q9P270 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLAIN2Q9P270 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLAIN2Q9P270 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SLAIN2Q9P270 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SLAIN2Q9P270 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLAIN2Q9P270 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLAIN2Q9P270 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLAIN2Q9P270 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLAIN2Q9P270 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLAIN2Q9P270 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLAIN2Q9P270 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms