Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7N4

SCAF1, Splicing factor, arginine/serine-rich 19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF1Q9H7N4 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCAF1Q9H7N4 APOH-201ENST00000205948 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCAF1Q9H7N4 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCAF1Q9H7N4 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCAF1Q9H7N4 AC073310.1-201ENST00000423226 1033 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SCAF1Q9H7N4 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCAF1Q9H7N4 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCAF1Q9H7N4 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCAF1Q9H7N4 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCAF1Q9H7N4 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCAF1Q9H7N4 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCAF1Q9H7N4 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCAF1Q9H7N4 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCAF1Q9H7N4 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCAF1Q9H7N4 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCAF1Q9H7N4 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCAF1Q9H7N4 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCAF1Q9H7N4 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCAF1Q9H7N4 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCAF1Q9H7N4 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCAF1Q9H7N4 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCAF1Q9H7N4 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCAF1Q9H7N4 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCAF1Q9H7N4 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCAF1Q9H7N4 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCAF1Q9H7N4 BX248415.1-201ENST00000367421 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SCAF1Q9H7N4 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SCAF1Q9H7N4 AC073115.1-201ENST00000436056 532 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SCAF1Q9H7N4 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
SCAF1Q9H7N4 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
SCAF1Q9H7N4 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
SCAF1Q9H7N4 AC122134.1-202ENST00000569111 1201 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
SCAF1Q9H7N4 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
SCAF1Q9H7N4 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SCAF1Q9H7N4 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
SCAF1Q9H7N4 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SCAF1Q9H7N4 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SCAF1Q9H7N4 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SCAF1Q9H7N4 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCAF1Q9H7N4 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCAF1Q9H7N4 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCAF1Q9H7N4 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCAF1Q9H7N4 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCAF1Q9H7N4 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCAF1Q9H7N4 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCAF1Q9H7N4 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCAF1Q9H7N4 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCAF1Q9H7N4 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SCAF1Q9H7N4 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCAF1Q9H7N4 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SCAF1Q9H7N4 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCAF1Q9H7N4 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCAF1Q9H7N4 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCAF1Q9H7N4 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCAF1Q9H7N4 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCAF1Q9H7N4 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SCAF1Q9H7N4 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SCAF1Q9H7N4 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCAF1Q9H7N4 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCAF1Q9H7N4 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCAF1Q9H7N4 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SCAF1Q9H7N4 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCAF1Q9H7N4 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCAF1Q9H7N4 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCAF1Q9H7N4 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCAF1Q9H7N4 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCAF1Q9H7N4 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCAF1Q9H7N4 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCAF1Q9H7N4 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCAF1Q9H7N4 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCAF1Q9H7N4 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCAF1Q9H7N4 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCAF1Q9H7N4 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCAF1Q9H7N4 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCAF1Q9H7N4 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCAF1Q9H7N4 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCAF1Q9H7N4 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCAF1Q9H7N4 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCAF1Q9H7N4 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCAF1Q9H7N4 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCAF1Q9H7N4 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCAF1Q9H7N4 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCAF1Q9H7N4 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCAF1Q9H7N4 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SCAF1Q9H7N4 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCAF1Q9H7N4 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCAF1Q9H7N4 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCAF1Q9H7N4 AL137246.1-201ENST00000607072 977 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SCAF1Q9H7N4 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SCAF1Q9H7N4 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SCAF1Q9H7N4 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCAF1Q9H7N4 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCAF1Q9H7N4 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCAF1Q9H7N4 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCAF1Q9H7N4 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCAF1Q9H7N4 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCAF1Q9H7N4 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCAF1Q9H7N4 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCAF1Q9H7N4 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCAF1Q9H7N4 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms