Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN0

GPR88, Probable G-protein coupled receptor 88, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR88Q9GZN0 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPR88Q9GZN0 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPR88Q9GZN0 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPR88Q9GZN0 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPR88Q9GZN0 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPR88Q9GZN0 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPR88Q9GZN0 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPR88Q9GZN0 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPR88Q9GZN0 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPR88Q9GZN0 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPR88Q9GZN0 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPR88Q9GZN0 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPR88Q9GZN0 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPR88Q9GZN0 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPR88Q9GZN0 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPR88Q9GZN0 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPR88Q9GZN0 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPR88Q9GZN0 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPR88Q9GZN0 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPR88Q9GZN0 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPR88Q9GZN0 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPR88Q9GZN0 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPR88Q9GZN0 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPR88Q9GZN0 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPR88Q9GZN0 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPR88Q9GZN0 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GPR88Q9GZN0 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPR88Q9GZN0 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPR88Q9GZN0 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPR88Q9GZN0 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPR88Q9GZN0 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPR88Q9GZN0 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPR88Q9GZN0 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPR88Q9GZN0 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPR88Q9GZN0 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPR88Q9GZN0 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GPR88Q9GZN0 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPR88Q9GZN0 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPR88Q9GZN0 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPR88Q9GZN0 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPR88Q9GZN0 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPR88Q9GZN0 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPR88Q9GZN0 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPR88Q9GZN0 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPR88Q9GZN0 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPR88Q9GZN0 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPR88Q9GZN0 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPR88Q9GZN0 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPR88Q9GZN0 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPR88Q9GZN0 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPR88Q9GZN0 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPR88Q9GZN0 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GPR88Q9GZN0 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPR88Q9GZN0 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GPR88Q9GZN0 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPR88Q9GZN0 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPR88Q9GZN0 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPR88Q9GZN0 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GPR88Q9GZN0 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPR88Q9GZN0 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPR88Q9GZN0 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GPR88Q9GZN0 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPR88Q9GZN0 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPR88Q9GZN0 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPR88Q9GZN0 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPR88Q9GZN0 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPR88Q9GZN0 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPR88Q9GZN0 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPR88Q9GZN0 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPR88Q9GZN0 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPR88Q9GZN0 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPR88Q9GZN0 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPR88Q9GZN0 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPR88Q9GZN0 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GPR88Q9GZN0 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GPR88Q9GZN0 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GPR88Q9GZN0 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GPR88Q9GZN0 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GPR88Q9GZN0 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GPR88Q9GZN0 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GPR88Q9GZN0 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GPR88Q9GZN0 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GPR88Q9GZN0 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GPR88Q9GZN0 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GPR88Q9GZN0 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GPR88Q9GZN0 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GPR88Q9GZN0 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GPR88Q9GZN0 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GPR88Q9GZN0 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GPR88Q9GZN0 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GPR88Q9GZN0 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GPR88Q9GZN0 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GPR88Q9GZN0 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GPR88Q9GZN0 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GPR88Q9GZN0 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GPR88Q9GZN0 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GPR88Q9GZN0 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GPR88Q9GZN0 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GPR88Q9GZN0 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GPR88Q9GZN0 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms