Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 900 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CCSER1Q9C0I3 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCSER1Q9C0I3 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCSER1Q9C0I3 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCSER1Q9C0I3 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCSER1Q9C0I3 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCSER1Q9C0I3 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCSER1Q9C0I3 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCSER1Q9C0I3 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCSER1Q9C0I3 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCSER1Q9C0I3 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCSER1Q9C0I3 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CCSER1Q9C0I3 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCSER1Q9C0I3 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCSER1Q9C0I3 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCSER1Q9C0I3 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCSER1Q9C0I3 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCSER1Q9C0I3 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCSER1Q9C0I3 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCSER1Q9C0I3 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCSER1Q9C0I3 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCSER1Q9C0I3 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCSER1Q9C0I3 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCSER1Q9C0I3 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCSER1Q9C0I3 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCSER1Q9C0I3 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCSER1Q9C0I3 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCSER1Q9C0I3 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCSER1Q9C0I3 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCSER1Q9C0I3 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCSER1Q9C0I3 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCSER1Q9C0I3 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCSER1Q9C0I3 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCSER1Q9C0I3 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCSER1Q9C0I3 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCSER1Q9C0I3 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCSER1Q9C0I3 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCSER1Q9C0I3 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCSER1Q9C0I3 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCSER1Q9C0I3 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCSER1Q9C0I3 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCSER1Q9C0I3 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCSER1Q9C0I3 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCSER1Q9C0I3 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCSER1Q9C0I3 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCSER1Q9C0I3 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCSER1Q9C0I3 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCSER1Q9C0I3 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCSER1Q9C0I3 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCSER1Q9C0I3 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCSER1Q9C0I3 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCSER1Q9C0I3 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCSER1Q9C0I3 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCSER1Q9C0I3 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCSER1Q9C0I3 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCSER1Q9C0I3 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCSER1Q9C0I3 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCSER1Q9C0I3 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCSER1Q9C0I3 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCSER1Q9C0I3 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCSER1Q9C0I3 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCSER1Q9C0I3 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCSER1Q9C0I3 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCSER1Q9C0I3 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCSER1Q9C0I3 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCSER1Q9C0I3 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCSER1Q9C0I3 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCSER1Q9C0I3 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms