Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY41

HDAC8, Histone deacetylase 8, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8Q9BY41 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms