Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXS0

COL25A1, Collagen alpha-1(XXV) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL25A1Q9BXS0 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
COL25A1Q9BXS0 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COL25A1Q9BXS0 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COL25A1Q9BXS0 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COL25A1Q9BXS0 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COL25A1Q9BXS0 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COL25A1Q9BXS0 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
COL25A1Q9BXS0 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COL25A1Q9BXS0 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COL25A1Q9BXS0 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COL25A1Q9BXS0 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COL25A1Q9BXS0 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COL25A1Q9BXS0 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COL25A1Q9BXS0 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COL25A1Q9BXS0 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COL25A1Q9BXS0 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COL25A1Q9BXS0 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL25A1Q9BXS0 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL25A1Q9BXS0 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL25A1Q9BXS0 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL25A1Q9BXS0 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL25A1Q9BXS0 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL25A1Q9BXS0 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL25A1Q9BXS0 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL25A1Q9BXS0 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL25A1Q9BXS0 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL25A1Q9BXS0 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL25A1Q9BXS0 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL25A1Q9BXS0 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
COL25A1Q9BXS0 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL25A1Q9BXS0 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
COL25A1Q9BXS0 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
COL25A1Q9BXS0 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL25A1Q9BXS0 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL25A1Q9BXS0 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL25A1Q9BXS0 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL25A1Q9BXS0 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL25A1Q9BXS0 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL25A1Q9BXS0 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL25A1Q9BXS0 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL25A1Q9BXS0 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL25A1Q9BXS0 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL25A1Q9BXS0 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL25A1Q9BXS0 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL25A1Q9BXS0 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL25A1Q9BXS0 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
COL25A1Q9BXS0 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL25A1Q9BXS0 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL25A1Q9BXS0 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
COL25A1Q9BXS0 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL25A1Q9BXS0 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL25A1Q9BXS0 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL25A1Q9BXS0 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL25A1Q9BXS0 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL25A1Q9BXS0 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL25A1Q9BXS0 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL25A1Q9BXS0 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL25A1Q9BXS0 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL25A1Q9BXS0 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL25A1Q9BXS0 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL25A1Q9BXS0 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COL25A1Q9BXS0 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COL25A1Q9BXS0 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COL25A1Q9BXS0 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COL25A1Q9BXS0 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COL25A1Q9BXS0 TNNT3-201ENST00000278317 1210 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COL25A1Q9BXS0 UROS-201ENST00000368774 744 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COL25A1Q9BXS0 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COL25A1Q9BXS0 TNNT3-207ENST00000381589 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COL25A1Q9BXS0 IGHEP1-201ENST00000521393 651 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
COL25A1Q9BXS0 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
COL25A1Q9BXS0 AC027139.1-201ENST00000565286 951 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
COL25A1Q9BXS0 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COL25A1Q9BXS0 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COL25A1Q9BXS0 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COL25A1Q9BXS0 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COL25A1Q9BXS0 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COL25A1Q9BXS0 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COL25A1Q9BXS0 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
COL25A1Q9BXS0 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COL25A1Q9BXS0 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COL25A1Q9BXS0 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COL25A1Q9BXS0 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COL25A1Q9BXS0 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COL25A1Q9BXS0 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COL25A1Q9BXS0 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COL25A1Q9BXS0 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COL25A1Q9BXS0 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COL25A1Q9BXS0 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COL25A1Q9BXS0 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COL25A1Q9BXS0 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COL25A1Q9BXS0 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COL25A1Q9BXS0 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COL25A1Q9BXS0 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COL25A1Q9BXS0 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COL25A1Q9BXS0 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COL25A1Q9BXS0 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COL25A1Q9BXS0 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COL25A1Q9BXS0 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COL25A1Q9BXS0 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms