Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYCP2Q9BX26 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYCP2Q9BX26 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SYCP2Q9BX26 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYCP2Q9BX26 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYCP2Q9BX26 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYCP2Q9BX26 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SYCP2Q9BX26 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYCP2Q9BX26 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYCP2Q9BX26 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYCP2Q9BX26 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYCP2Q9BX26 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYCP2Q9BX26 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYCP2Q9BX26 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYCP2Q9BX26 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYCP2Q9BX26 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYCP2Q9BX26 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYCP2Q9BX26 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYCP2Q9BX26 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYCP2Q9BX26 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYCP2Q9BX26 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYCP2Q9BX26 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYCP2Q9BX26 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SYCP2Q9BX26 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYCP2Q9BX26 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYCP2Q9BX26 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYCP2Q9BX26 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYCP2Q9BX26 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYCP2Q9BX26 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SYCP2Q9BX26 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYCP2Q9BX26 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYCP2Q9BX26 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYCP2Q9BX26 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYCP2Q9BX26 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYCP2Q9BX26 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYCP2Q9BX26 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYCP2Q9BX26 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYCP2Q9BX26 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SYCP2Q9BX26 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SYCP2Q9BX26 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SYCP2Q9BX26 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SYCP2Q9BX26 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYCP2Q9BX26 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYCP2Q9BX26 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYCP2Q9BX26 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYCP2Q9BX26 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYCP2Q9BX26 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYCP2Q9BX26 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYCP2Q9BX26 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYCP2Q9BX26 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYCP2Q9BX26 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYCP2Q9BX26 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYCP2Q9BX26 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYCP2Q9BX26 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYCP2Q9BX26 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYCP2Q9BX26 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYCP2Q9BX26 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYCP2Q9BX26 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SYCP2Q9BX26 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SYCP2Q9BX26 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYCP2Q9BX26 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYCP2Q9BX26 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SYCP2Q9BX26 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SYCP2Q9BX26 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYCP2Q9BX26 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYCP2Q9BX26 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYCP2Q9BX26 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYCP2Q9BX26 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SYCP2Q9BX26 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYCP2Q9BX26 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SYCP2Q9BX26 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYCP2Q9BX26 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYCP2Q9BX26 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYCP2Q9BX26 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYCP2Q9BX26 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYCP2Q9BX26 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYCP2Q9BX26 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYCP2Q9BX26 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYCP2Q9BX26 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYCP2Q9BX26 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYCP2Q9BX26 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SYCP2Q9BX26 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYCP2Q9BX26 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYCP2Q9BX26 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SYCP2Q9BX26 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYCP2Q9BX26 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYCP2Q9BX26 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYCP2Q9BX26 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYCP2Q9BX26 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYCP2Q9BX26 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYCP2Q9BX26 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYCP2Q9BX26 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYCP2Q9BX26 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYCP2Q9BX26 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYCP2Q9BX26 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYCP2Q9BX26 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYCP2Q9BX26 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYCP2Q9BX26 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYCP2Q9BX26 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYCP2Q9BX26 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms