Protein–RNA interactions for Protein: Q96CS3

FAF2, FAS-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAF2Q96CS3 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAF2Q96CS3 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAF2Q96CS3 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAF2Q96CS3 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAF2Q96CS3 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAF2Q96CS3 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAF2Q96CS3 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAF2Q96CS3 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAF2Q96CS3 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAF2Q96CS3 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAF2Q96CS3 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
FAF2Q96CS3 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAF2Q96CS3 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAF2Q96CS3 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAF2Q96CS3 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAF2Q96CS3 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAF2Q96CS3 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAF2Q96CS3 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
FAF2Q96CS3 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAF2Q96CS3 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
FAF2Q96CS3 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
FAF2Q96CS3 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAF2Q96CS3 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAF2Q96CS3 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAF2Q96CS3 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAF2Q96CS3 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms