Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms