Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBE1

CNIH3, Protein cornichon homolog 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH3Q8TBE1 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNIH3Q8TBE1 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CNIH3Q8TBE1 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNIH3Q8TBE1 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNIH3Q8TBE1 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CNIH3Q8TBE1 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNIH3Q8TBE1 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNIH3Q8TBE1 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNIH3Q8TBE1 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNIH3Q8TBE1 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CNIH3Q8TBE1 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNIH3Q8TBE1 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNIH3Q8TBE1 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNIH3Q8TBE1 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNIH3Q8TBE1 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNIH3Q8TBE1 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNIH3Q8TBE1 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNIH3Q8TBE1 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNIH3Q8TBE1 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNIH3Q8TBE1 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNIH3Q8TBE1 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNIH3Q8TBE1 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNIH3Q8TBE1 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNIH3Q8TBE1 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNIH3Q8TBE1 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNIH3Q8TBE1 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNIH3Q8TBE1 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNIH3Q8TBE1 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CNIH3Q8TBE1 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNIH3Q8TBE1 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNIH3Q8TBE1 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNIH3Q8TBE1 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNIH3Q8TBE1 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNIH3Q8TBE1 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNIH3Q8TBE1 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNIH3Q8TBE1 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNIH3Q8TBE1 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNIH3Q8TBE1 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNIH3Q8TBE1 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNIH3Q8TBE1 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNIH3Q8TBE1 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CNIH3Q8TBE1 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CNIH3Q8TBE1 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNIH3Q8TBE1 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CNIH3Q8TBE1 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNIH3Q8TBE1 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNIH3Q8TBE1 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNIH3Q8TBE1 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNIH3Q8TBE1 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNIH3Q8TBE1 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNIH3Q8TBE1 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNIH3Q8TBE1 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNIH3Q8TBE1 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNIH3Q8TBE1 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNIH3Q8TBE1 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNIH3Q8TBE1 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNIH3Q8TBE1 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNIH3Q8TBE1 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNIH3Q8TBE1 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNIH3Q8TBE1 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNIH3Q8TBE1 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNIH3Q8TBE1 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNIH3Q8TBE1 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNIH3Q8TBE1 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNIH3Q8TBE1 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNIH3Q8TBE1 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNIH3Q8TBE1 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNIH3Q8TBE1 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNIH3Q8TBE1 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNIH3Q8TBE1 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNIH3Q8TBE1 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNIH3Q8TBE1 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNIH3Q8TBE1 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNIH3Q8TBE1 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CNIH3Q8TBE1 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNIH3Q8TBE1 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNIH3Q8TBE1 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNIH3Q8TBE1 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNIH3Q8TBE1 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNIH3Q8TBE1 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNIH3Q8TBE1 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNIH3Q8TBE1 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNIH3Q8TBE1 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNIH3Q8TBE1 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CNIH3Q8TBE1 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNIH3Q8TBE1 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNIH3Q8TBE1 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNIH3Q8TBE1 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNIH3Q8TBE1 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNIH3Q8TBE1 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNIH3Q8TBE1 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNIH3Q8TBE1 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNIH3Q8TBE1 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNIH3Q8TBE1 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNIH3Q8TBE1 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
CNIH3Q8TBE1 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNIH3Q8TBE1 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNIH3Q8TBE1 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNIH3Q8TBE1 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNIH3Q8TBE1 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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