Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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ZNF548Q8NEK5 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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ZNF548Q8NEK5 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
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ZNF548Q8NEK5 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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