Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW8

TTC21A, Tetratricopeptide repeat protein 21A, humanhuman

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC21AQ8NDW8 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TTC21AQ8NDW8 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms