Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3Z3

GTPBP8, GTP-binding protein 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP8Q8N3Z3 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTPBP8Q8N3Z3 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTPBP8Q8N3Z3 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTPBP8Q8N3Z3 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTPBP8Q8N3Z3 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GTPBP8Q8N3Z3 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTPBP8Q8N3Z3 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTPBP8Q8N3Z3 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTPBP8Q8N3Z3 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GTPBP8Q8N3Z3 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTPBP8Q8N3Z3 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTPBP8Q8N3Z3 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GTPBP8Q8N3Z3 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTPBP8Q8N3Z3 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTPBP8Q8N3Z3 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GTPBP8Q8N3Z3 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GTPBP8Q8N3Z3 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTPBP8Q8N3Z3 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTPBP8Q8N3Z3 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTPBP8Q8N3Z3 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTPBP8Q8N3Z3 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTPBP8Q8N3Z3 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTPBP8Q8N3Z3 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTPBP8Q8N3Z3 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTPBP8Q8N3Z3 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTPBP8Q8N3Z3 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTPBP8Q8N3Z3 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTPBP8Q8N3Z3 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTPBP8Q8N3Z3 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GTPBP8Q8N3Z3 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTPBP8Q8N3Z3 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTPBP8Q8N3Z3 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GTPBP8Q8N3Z3 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GTPBP8Q8N3Z3 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GTPBP8Q8N3Z3 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GTPBP8Q8N3Z3 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GTPBP8Q8N3Z3 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GTPBP8Q8N3Z3 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GTPBP8Q8N3Z3 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GTPBP8Q8N3Z3 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GTPBP8Q8N3Z3 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GTPBP8Q8N3Z3 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GTPBP8Q8N3Z3 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GTPBP8Q8N3Z3 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GTPBP8Q8N3Z3 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GTPBP8Q8N3Z3 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GTPBP8Q8N3Z3 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
GTPBP8Q8N3Z3 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GTPBP8Q8N3Z3 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GTPBP8Q8N3Z3 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GTPBP8Q8N3Z3 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GTPBP8Q8N3Z3 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GTPBP8Q8N3Z3 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GTPBP8Q8N3Z3 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GTPBP8Q8N3Z3 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GTPBP8Q8N3Z3 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GTPBP8Q8N3Z3 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GTPBP8Q8N3Z3 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GTPBP8Q8N3Z3 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GTPBP8Q8N3Z3 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GTPBP8Q8N3Z3 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GTPBP8Q8N3Z3 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GTPBP8Q8N3Z3 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GTPBP8Q8N3Z3 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GTPBP8Q8N3Z3 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GTPBP8Q8N3Z3 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GTPBP8Q8N3Z3 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GTPBP8Q8N3Z3 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GTPBP8Q8N3Z3 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GTPBP8Q8N3Z3 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GTPBP8Q8N3Z3 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GTPBP8Q8N3Z3 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GTPBP8Q8N3Z3 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GTPBP8Q8N3Z3 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GTPBP8Q8N3Z3 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GTPBP8Q8N3Z3 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GTPBP8Q8N3Z3 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GTPBP8Q8N3Z3 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GTPBP8Q8N3Z3 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GTPBP8Q8N3Z3 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GTPBP8Q8N3Z3 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GTPBP8Q8N3Z3 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GTPBP8Q8N3Z3 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GTPBP8Q8N3Z3 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GTPBP8Q8N3Z3 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GTPBP8Q8N3Z3 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GTPBP8Q8N3Z3 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GTPBP8Q8N3Z3 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GTPBP8Q8N3Z3 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GTPBP8Q8N3Z3 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GTPBP8Q8N3Z3 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GTPBP8Q8N3Z3 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GTPBP8Q8N3Z3 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GTPBP8Q8N3Z3 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GTPBP8Q8N3Z3 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
GTPBP8Q8N3Z3 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GTPBP8Q8N3Z3 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GTPBP8Q8N3Z3 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
GTPBP8Q8N3Z3 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GTPBP8Q8N3Z3 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms