Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.2 ms