Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms