Protein–RNA interactions for Protein: Q76B58

BRINP3, BMP/retinoic acid-inducible neural-specific protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRINP3Q76B58 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRINP3Q76B58 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRINP3Q76B58 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRINP3Q76B58 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRINP3Q76B58 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
BRINP3Q76B58 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRINP3Q76B58 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRINP3Q76B58 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRINP3Q76B58 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
BRINP3Q76B58 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRINP3Q76B58 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRINP3Q76B58 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms