Protein–RNA interactions for Protein: Q6KF10

GDF6, Growth/differentiation factor 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF6Q6KF10 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GDF6Q6KF10 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GDF6Q6KF10 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GDF6Q6KF10 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GDF6Q6KF10 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GDF6Q6KF10 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GDF6Q6KF10 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GDF6Q6KF10 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GDF6Q6KF10 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GDF6Q6KF10 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GDF6Q6KF10 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GDF6Q6KF10 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GDF6Q6KF10 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GDF6Q6KF10 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GDF6Q6KF10 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GDF6Q6KF10 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GDF6Q6KF10 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GDF6Q6KF10 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GDF6Q6KF10 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GDF6Q6KF10 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GDF6Q6KF10 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GDF6Q6KF10 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GDF6Q6KF10 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GDF6Q6KF10 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GDF6Q6KF10 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GDF6Q6KF10 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GDF6Q6KF10 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GDF6Q6KF10 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GDF6Q6KF10 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GDF6Q6KF10 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GDF6Q6KF10 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GDF6Q6KF10 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GDF6Q6KF10 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
GDF6Q6KF10 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GDF6Q6KF10 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GDF6Q6KF10 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GDF6Q6KF10 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GDF6Q6KF10 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
GDF6Q6KF10 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
GDF6Q6KF10 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GDF6Q6KF10 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GDF6Q6KF10 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GDF6Q6KF10 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
GDF6Q6KF10 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
GDF6Q6KF10 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
GDF6Q6KF10 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GDF6Q6KF10 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GDF6Q6KF10 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GDF6Q6KF10 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GDF6Q6KF10 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GDF6Q6KF10 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GDF6Q6KF10 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GDF6Q6KF10 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GDF6Q6KF10 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GDF6Q6KF10 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GDF6Q6KF10 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GDF6Q6KF10 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GDF6Q6KF10 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GDF6Q6KF10 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GDF6Q6KF10 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GDF6Q6KF10 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GDF6Q6KF10 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GDF6Q6KF10 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GDF6Q6KF10 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GDF6Q6KF10 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GDF6Q6KF10 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GDF6Q6KF10 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GDF6Q6KF10 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GDF6Q6KF10 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GDF6Q6KF10 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GDF6Q6KF10 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GDF6Q6KF10 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GDF6Q6KF10 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GDF6Q6KF10 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GDF6Q6KF10 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GDF6Q6KF10 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GDF6Q6KF10 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GDF6Q6KF10 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GDF6Q6KF10 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GDF6Q6KF10 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GDF6Q6KF10 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GDF6Q6KF10 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GDF6Q6KF10 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GDF6Q6KF10 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GDF6Q6KF10 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
GDF6Q6KF10 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GDF6Q6KF10 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GDF6Q6KF10 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GDF6Q6KF10 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GDF6Q6KF10 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GDF6Q6KF10 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GDF6Q6KF10 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GDF6Q6KF10 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
GDF6Q6KF10 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GDF6Q6KF10 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GDF6Q6KF10 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
GDF6Q6KF10 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GDF6Q6KF10 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GDF6Q6KF10 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GDF6Q6KF10 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.5 ms