Protein–RNA interactions for Protein: Q5U3C3

TMEM164, Transmembrane protein 164, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM164Q5U3C3 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms