Protein–RNA interactions for Protein: Q5H8C1

FREM1, FRAS1-related extracellular matrix protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FREM1Q5H8C1 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
FREM1Q5H8C1 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
FREM1Q5H8C1 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
FREM1Q5H8C1 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
FREM1Q5H8C1 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
FREM1Q5H8C1 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
FREM1Q5H8C1 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.1
FREM1Q5H8C1 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
FREM1Q5H8C1 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.1
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