Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms