Protein–RNA interactions for Protein: Q53FZ2

ACSM3, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM3Q53FZ2 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms