Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM259Q4ZIN3 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms