Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY05

LINC00303, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00303, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00303Q3SY05 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms