Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms