Protein–RNA interactions for Protein: Q2M1V0

ISX, Intestine-specific homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISXQ2M1V0 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms