Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM187BQ17R55 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM187BQ17R55 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM187BQ17R55 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM187BQ17R55 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
FAM187BQ17R55 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
FAM187BQ17R55 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
FAM187BQ17R55 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
FAM187BQ17R55 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
FAM187BQ17R55 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
FAM187BQ17R55 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
FAM187BQ17R55 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
FAM187BQ17R55 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
FAM187BQ17R55 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms