Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
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