Protein–RNA interactions for Protein: Q16695

HIST3H3, Histone H3.1t, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST3H3Q16695 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
HIST3H3Q16695 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HIST3H3Q16695 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HIST3H3Q16695 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HIST3H3Q16695 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HIST3H3Q16695 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HIST3H3Q16695 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HIST3H3Q16695 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HIST3H3Q16695 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HIST3H3Q16695 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
HIST3H3Q16695 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HIST3H3Q16695 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HIST3H3Q16695 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
HIST3H3Q16695 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HIST3H3Q16695 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HIST3H3Q16695 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HIST3H3Q16695 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HIST3H3Q16695 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
HIST3H3Q16695 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HIST3H3Q16695 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HIST3H3Q16695 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HIST3H3Q16695 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
HIST3H3Q16695 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HIST3H3Q16695 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HIST3H3Q16695 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HIST3H3Q16695 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HIST3H3Q16695 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HIST3H3Q16695 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HIST3H3Q16695 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HIST3H3Q16695 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HIST3H3Q16695 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HIST3H3Q16695 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HIST3H3Q16695 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HIST3H3Q16695 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HIST3H3Q16695 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HIST3H3Q16695 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HIST3H3Q16695 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HIST3H3Q16695 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HIST3H3Q16695 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HIST3H3Q16695 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HIST3H3Q16695 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
HIST3H3Q16695 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HIST3H3Q16695 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HIST3H3Q16695 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HIST3H3Q16695 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HIST3H3Q16695 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HIST3H3Q16695 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HIST3H3Q16695 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HIST3H3Q16695 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HIST3H3Q16695 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HIST3H3Q16695 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HIST3H3Q16695 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HIST3H3Q16695 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HIST3H3Q16695 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HIST3H3Q16695 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HIST3H3Q16695 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HIST3H3Q16695 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HIST3H3Q16695 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HIST3H3Q16695 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HIST3H3Q16695 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HIST3H3Q16695 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HIST3H3Q16695 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HIST3H3Q16695 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
HIST3H3Q16695 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HIST3H3Q16695 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HIST3H3Q16695 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
HIST3H3Q16695 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HIST3H3Q16695 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
HIST3H3Q16695 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
HIST3H3Q16695 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
HIST3H3Q16695 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HIST3H3Q16695 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HIST3H3Q16695 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HIST3H3Q16695 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HIST3H3Q16695 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HIST3H3Q16695 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HIST3H3Q16695 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HIST3H3Q16695 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HIST3H3Q16695 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HIST3H3Q16695 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HIST3H3Q16695 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HIST3H3Q16695 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HIST3H3Q16695 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HIST3H3Q16695 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HIST3H3Q16695 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HIST3H3Q16695 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
HIST3H3Q16695 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HIST3H3Q16695 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HIST3H3Q16695 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HIST3H3Q16695 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HIST3H3Q16695 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HIST3H3Q16695 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HIST3H3Q16695 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HIST3H3Q16695 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HIST3H3Q16695 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HIST3H3Q16695 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HIST3H3Q16695 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HIST3H3Q16695 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HIST3H3Q16695 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
HIST3H3Q16695 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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