Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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