Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
SLC18A3Q16572 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
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