Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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