Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
USF2Q15853 LAMA3-202ENST00000313654 10661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
USF2Q15853 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
USF2Q15853 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
USF2Q15853 ZNF275-201ENST00000370249 5920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
USF2Q15853 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
USF2Q15853 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
USF2Q15853 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
USF2Q15853 USP19-202ENST00000398888 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
USF2Q15853 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
USF2Q15853 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
USF2Q15853 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
USF2Q15853 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
USF2Q15853 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
USF2Q15853 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
USF2Q15853 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
USF2Q15853 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
USF2Q15853 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
USF2Q15853 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
USF2Q15853 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
USF2Q15853 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
USF2Q15853 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
USF2Q15853 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
USF2Q15853 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
USF2Q15853 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
USF2Q15853 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
USF2Q15853 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
USF2Q15853 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
USF2Q15853 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
USF2Q15853 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
USF2Q15853 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
USF2Q15853 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
USF2Q15853 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
USF2Q15853 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
USF2Q15853 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
USF2Q15853 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
USF2Q15853 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
USF2Q15853 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
USF2Q15853 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
USF2Q15853 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
USF2Q15853 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
USF2Q15853 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
USF2Q15853 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
USF2Q15853 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
USF2Q15853 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
USF2Q15853 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
USF2Q15853 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
USF2Q15853 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
USF2Q15853 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
USF2Q15853 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
USF2Q15853 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
USF2Q15853 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
USF2Q15853 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
USF2Q15853 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
USF2Q15853 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
USF2Q15853 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
USF2Q15853 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
USF2Q15853 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
USF2Q15853 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
USF2Q15853 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
USF2Q15853 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
USF2Q15853 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
USF2Q15853 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
USF2Q15853 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
USF2Q15853 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
USF2Q15853 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
USF2Q15853 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
USF2Q15853 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
USF2Q15853 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
USF2Q15853 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
USF2Q15853 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
USF2Q15853 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
USF2Q15853 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
USF2Q15853 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
USF2Q15853 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
USF2Q15853 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
USF2Q15853 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
USF2Q15853 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
USF2Q15853 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
USF2Q15853 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
USF2Q15853 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
USF2Q15853 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
USF2Q15853 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
USF2Q15853 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
USF2Q15853 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
USF2Q15853 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
USF2Q15853 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
USF2Q15853 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
USF2Q15853 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
USF2Q15853 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
USF2Q15853 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
USF2Q15853 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
USF2Q15853 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
USF2Q15853 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
USF2Q15853 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
USF2Q15853 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
USF2Q15853 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
USF2Q15853 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
USF2Q15853 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
USF2Q15853 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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