Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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