Protein–RNA interactions for Protein: Q15154

PCM1, Pericentriolar material 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,024 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCM1Q15154 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms