Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NME3Q13232 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NME3Q13232 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
NME3Q13232 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NME3Q13232 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NME3Q13232 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NME3Q13232 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NME3Q13232 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NME3Q13232 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NME3Q13232 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NME3Q13232 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NME3Q13232 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
NME3Q13232 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NME3Q13232 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NME3Q13232 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NME3Q13232 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NME3Q13232 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
NME3Q13232 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NME3Q13232 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
NME3Q13232 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NME3Q13232 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NME3Q13232 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NME3Q13232 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NME3Q13232 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NME3Q13232 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
NME3Q13232 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NME3Q13232 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NME3Q13232 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NME3Q13232 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NME3Q13232 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NME3Q13232 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NME3Q13232 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NME3Q13232 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
NME3Q13232 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NME3Q13232 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NME3Q13232 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NME3Q13232 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NME3Q13232 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NME3Q13232 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NME3Q13232 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NME3Q13232 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NME3Q13232 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NME3Q13232 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NME3Q13232 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NME3Q13232 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NME3Q13232 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NME3Q13232 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NME3Q13232 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NME3Q13232 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NME3Q13232 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NME3Q13232 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NME3Q13232 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NME3Q13232 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NME3Q13232 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
NME3Q13232 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
NME3Q13232 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NME3Q13232 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NME3Q13232 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NME3Q13232 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NME3Q13232 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NME3Q13232 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NME3Q13232 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NME3Q13232 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NME3Q13232 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NME3Q13232 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NME3Q13232 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NME3Q13232 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NME3Q13232 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NME3Q13232 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NME3Q13232 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NME3Q13232 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NME3Q13232 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NME3Q13232 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NME3Q13232 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NME3Q13232 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NME3Q13232 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NME3Q13232 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NME3Q13232 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NME3Q13232 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NME3Q13232 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NME3Q13232 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NME3Q13232 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NME3Q13232 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NME3Q13232 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NME3Q13232 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NME3Q13232 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NME3Q13232 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NME3Q13232 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NME3Q13232 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
NME3Q13232 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NME3Q13232 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NME3Q13232 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NME3Q13232 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NME3Q13232 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NME3Q13232 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NME3Q13232 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NME3Q13232 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NME3Q13232 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NME3Q13232 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
NME3Q13232 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
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