Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 AC137695.1-201ENST00000604126 489 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
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