Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

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Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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