Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLFN5Q08AF3 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms