Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms