Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
XPCQ01831 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
XPCQ01831 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
XPCQ01831 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
XPCQ01831 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
XPCQ01831 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
XPCQ01831 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
XPCQ01831 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
XPCQ01831 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
XPCQ01831 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
XPCQ01831 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
XPCQ01831 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
XPCQ01831 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
XPCQ01831 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
XPCQ01831 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
XPCQ01831 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
XPCQ01831 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
XPCQ01831 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
XPCQ01831 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
XPCQ01831 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
XPCQ01831 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
XPCQ01831 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
XPCQ01831 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
XPCQ01831 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
XPCQ01831 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
XPCQ01831 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
XPCQ01831 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
XPCQ01831 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
XPCQ01831 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
XPCQ01831 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
XPCQ01831 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
XPCQ01831 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
XPCQ01831 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
XPCQ01831 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
XPCQ01831 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
XPCQ01831 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
XPCQ01831 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
XPCQ01831 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
XPCQ01831 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
XPCQ01831 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
XPCQ01831 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
XPCQ01831 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
XPCQ01831 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
XPCQ01831 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
XPCQ01831 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
XPCQ01831 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
XPCQ01831 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
XPCQ01831 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
XPCQ01831 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
XPCQ01831 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
XPCQ01831 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
XPCQ01831 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
XPCQ01831 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
XPCQ01831 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
XPCQ01831 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
XPCQ01831 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
XPCQ01831 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
XPCQ01831 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
XPCQ01831 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
XPCQ01831 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
XPCQ01831 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
XPCQ01831 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
XPCQ01831 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
XPCQ01831 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
XPCQ01831 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
XPCQ01831 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
XPCQ01831 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
XPCQ01831 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
XPCQ01831 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
XPCQ01831 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
XPCQ01831 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
XPCQ01831 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
XPCQ01831 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
XPCQ01831 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
XPCQ01831 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
XPCQ01831 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
XPCQ01831 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
XPCQ01831 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
XPCQ01831 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
XPCQ01831 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
XPCQ01831 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
XPCQ01831 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
XPCQ01831 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
XPCQ01831 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
XPCQ01831 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
XPCQ01831 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
XPCQ01831 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
XPCQ01831 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
XPCQ01831 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
XPCQ01831 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
XPCQ01831 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
XPCQ01831 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
XPCQ01831 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
XPCQ01831 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
XPCQ01831 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
XPCQ01831 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
XPCQ01831 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
XPCQ01831 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
XPCQ01831 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
XPCQ01831 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms