Protein–RNA interactions for Protein: Q00526

CDK3, Cyclin-dependent kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK3Q00526 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms